Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG4

Nkain4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain4Q9JMG4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkain4Q9JMG4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nkain4Q9JMG4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkain4Q9JMG4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkain4Q9JMG4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkain4Q9JMG4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkain4Q9JMG4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms