Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ap3b2Q9JME5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ap3b2Q9JME5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ap3b2Q9JME5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ap3b2Q9JME5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ap3b2Q9JME5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ap3b2Q9JME5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ap3b2Q9JME5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ap3b2Q9JME5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ap3b2Q9JME5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ap3b2Q9JME5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ap3b2Q9JME5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ap3b2Q9JME5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ap3b2Q9JME5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ap3b2Q9JME5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ap3b2Q9JME5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ap3b2Q9JME5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ap3b2Q9JME5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ap3b2Q9JME5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ap3b2Q9JME5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ap3b2Q9JME5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ap3b2Q9JME5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ap3b2Q9JME5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ap3b2Q9JME5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ap3b2Q9JME5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ap3b2Q9JME5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ap3b2Q9JME5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ap3b2Q9JME5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ap3b2Q9JME5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ap3b2Q9JME5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ap3b2Q9JME5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ap3b2Q9JME5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ap3b2Q9JME5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ap3b2Q9JME5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ap3b2Q9JME5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ap3b2Q9JME5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ap3b2Q9JME5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ap3b2Q9JME5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms