Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms