Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gkap1Q9JMB0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gkap1Q9JMB0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gkap1Q9JMB0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gkap1Q9JMB0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gkap1Q9JMB0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gkap1Q9JMB0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gkap1Q9JMB0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gkap1Q9JMB0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gkap1Q9JMB0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gkap1Q9JMB0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gkap1Q9JMB0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gkap1Q9JMB0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gkap1Q9JMB0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gkap1Q9JMB0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms