Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prg4Q9JM99 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prg4Q9JM99 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prg4Q9JM99 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prg4Q9JM99 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prg4Q9JM99 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prg4Q9JM99 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prg4Q9JM99 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prg4Q9JM99 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prg4Q9JM99 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prg4Q9JM99 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prg4Q9JM99 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prg4Q9JM99 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prg4Q9JM99 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prg4Q9JM99 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prg4Q9JM99 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prg4Q9JM99 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prg4Q9JM99 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prg4Q9JM99 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prg4Q9JM99 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prg4Q9JM99 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prg4Q9JM99 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prg4Q9JM99 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prg4Q9JM99 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prg4Q9JM99 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prg4Q9JM99 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prg4Q9JM99 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prg4Q9JM99 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prg4Q9JM99 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prg4Q9JM99 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prg4Q9JM99 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prg4Q9JM99 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prg4Q9JM99 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prg4Q9JM99 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prg4Q9JM99 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prg4Q9JM99 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prg4Q9JM99 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prg4Q9JM99 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg4Q9JM99 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms