Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
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