Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cabp1Q9JLK7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cabp1Q9JLK7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms