Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh9a1Q9JLJ2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms