Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

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Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Tgm1Q9JLF6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Tgm1Q9JLF6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Tgm1Q9JLF6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms