Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nectin3Q9JLB9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nectin3Q9JLB9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nectin3Q9JLB9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nectin3Q9JLB9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nectin3Q9JLB9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nectin3Q9JLB9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nectin3Q9JLB9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nectin3Q9JLB9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nectin3Q9JLB9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nectin3Q9JLB9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nectin3Q9JLB9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nectin3Q9JLB9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nectin3Q9JLB9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nectin3Q9JLB9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nectin3Q9JLB9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nectin3Q9JLB9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nectin3Q9JLB9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nectin3Q9JLB9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nectin3Q9JLB9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nectin3Q9JLB9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nectin3Q9JLB9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nectin3Q9JLB9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nectin3Q9JLB9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nectin3Q9JLB9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nectin3Q9JLB9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nectin3Q9JLB9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nectin3Q9JLB9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nectin3Q9JLB9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nectin3Q9JLB9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nectin3Q9JLB9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nectin3Q9JLB9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nectin3Q9JLB9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nectin3Q9JLB9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nectin3Q9JLB9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nectin3Q9JLB9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nectin3Q9JLB9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nectin3Q9JLB9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nectin3Q9JLB9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nectin3Q9JLB9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nectin3Q9JLB9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nectin3Q9JLB9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms