Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Gde1Q9JL56 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gde1Q9JL56 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gde1Q9JL56 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gde1Q9JL56 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gde1Q9JL56 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gde1Q9JL56 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Gde1Q9JL56 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gde1Q9JL56 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gde1Q9JL56 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gde1Q9JL56 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gde1Q9JL56 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms