Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms