Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pole3Q9JKP7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pole3Q9JKP7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms