Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nova1Q9JKN6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms