Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmod2Q9JKK7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmod2Q9JKK7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmod2Q9JKK7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmod2Q9JKK7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmod2Q9JKK7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmod2Q9JKK7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmod2Q9JKK7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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Tmod2Q9JKK7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmod2Q9JKK7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmod2Q9JKK7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Tmod2Q9JKK7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmod2Q9JKK7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Tmod2Q9JKK7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmod2Q9JKK7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmod2Q9JKK7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Tmod2Q9JKK7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmod2Q9JKK7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmod2Q9JKK7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmod2Q9JKK7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmod2Q9JKK7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmod2Q9JKK7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmod2Q9JKK7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmod2Q9JKK7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmod2Q9JKK7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmod2Q9JKK7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmod2Q9JKK7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmod2Q9JKK7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmod2Q9JKK7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmod2Q9JKK7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmod2Q9JKK7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmod2Q9JKK7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmod2Q9JKK7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmod2Q9JKK7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmod2Q9JKK7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmod2Q9JKK7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Tmod2Q9JKK7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Tmod2Q9JKK7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmod2Q9JKK7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmod2Q9JKK7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmod2Q9JKK7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Tmod2Q9JKK7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmod2Q9JKK7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmod2Q9JKK7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmod2Q9JKK7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Tmod2Q9JKK7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Tmod2Q9JKK7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmod2Q9JKK7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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Tmod2Q9JKK7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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Tmod2Q9JKK7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmod2Q9JKK7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmod2Q9JKK7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmod2Q9JKK7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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