Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms