Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ybx3Q9JKB3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms