Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms