Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnga3Q9JJZ8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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