Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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