Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smad9Q9JIW5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms