Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lmbr1Q9JIT0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmbr1Q9JIT0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms