Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI7

Exosc9, Exosome complex component RRP45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc9Q9JHI7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Exosc9Q9JHI7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms