Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn12Q9ET43 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms