Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms