Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim39Q9ESN2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim39Q9ESN2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim39Q9ESN2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim39Q9ESN2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim39Q9ESN2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim39Q9ESN2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim39Q9ESN2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim39Q9ESN2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim39Q9ESN2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim39Q9ESN2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim39Q9ESN2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim39Q9ESN2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim39Q9ESN2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim39Q9ESN2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim39Q9ESN2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim39Q9ESN2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim39Q9ESN2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim39Q9ESN2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim39Q9ESN2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim39Q9ESN2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim39Q9ESN2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim39Q9ESN2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trim39Q9ESN2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trim39Q9ESN2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trim39Q9ESN2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trim39Q9ESN2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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Trim39Q9ESN2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim39Q9ESN2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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