Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESE1

Lrba, Lipopolysaccharide-responsive and beige-like anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LrbaQ9ESE1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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LrbaQ9ESE1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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LrbaQ9ESE1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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LrbaQ9ESE1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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LrbaQ9ESE1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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LrbaQ9ESE1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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LrbaQ9ESE1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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