Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SelenofQ9ERR7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SelenofQ9ERR7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SelenofQ9ERR7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SelenofQ9ERR7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SelenofQ9ERR7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SelenofQ9ERR7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SelenofQ9ERR7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SelenofQ9ERR7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SelenofQ9ERR7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SelenofQ9ERR7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SelenofQ9ERR7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SelenofQ9ERR7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SelenofQ9ERR7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SelenofQ9ERR7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SelenofQ9ERR7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SelenofQ9ERR7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SelenofQ9ERR7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SelenofQ9ERR7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SelenofQ9ERR7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SelenofQ9ERR7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SelenofQ9ERR7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SelenofQ9ERR7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SelenofQ9ERR7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SelenofQ9ERR7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SelenofQ9ERR7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SelenofQ9ERR7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SelenofQ9ERR7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SelenofQ9ERR7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SelenofQ9ERR7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SelenofQ9ERR7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SelenofQ9ERR7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SelenofQ9ERR7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SelenofQ9ERR7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SelenofQ9ERR7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SelenofQ9ERR7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SelenofQ9ERR7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SelenofQ9ERR7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SelenofQ9ERR7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SelenofQ9ERR7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SelenofQ9ERR7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms