Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Wdr61Q9ERF3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Wdr61Q9ERF3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Wdr61Q9ERF3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Wdr61Q9ERF3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Wdr61Q9ERF3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Wdr61Q9ERF3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Wdr61Q9ERF3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wdr61Q9ERF3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wdr61Q9ERF3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wdr61Q9ERF3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wdr61Q9ERF3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wdr61Q9ERF3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wdr61Q9ERF3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wdr61Q9ERF3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wdr61Q9ERF3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wdr61Q9ERF3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wdr61Q9ERF3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wdr61Q9ERF3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wdr61Q9ERF3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wdr61Q9ERF3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wdr61Q9ERF3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wdr61Q9ERF3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wdr61Q9ERF3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wdr61Q9ERF3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wdr61Q9ERF3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr61Q9ERF3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr61Q9ERF3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr61Q9ERF3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr61Q9ERF3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr61Q9ERF3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr61Q9ERF3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr61Q9ERF3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr61Q9ERF3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms