Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms