Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Tlr1Q9EPQ1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Tlr1Q9EPQ1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Tlr1Q9EPQ1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Tlr1Q9EPQ1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Tlr1Q9EPQ1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Tlr1Q9EPQ1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Tlr1Q9EPQ1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Tlr1Q9EPQ1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Tlr1Q9EPQ1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Tlr1Q9EPQ1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr1Q9EPQ1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms