Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SyncQ9EPM5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms