Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK6

Sil1, Nucleotide exchange factor SIL1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sil1Q9EPK6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sil1Q9EPK6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sil1Q9EPK6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms