Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpr88Q9EPB7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms