Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP93

Vmn1r53, Vomeronasal type-1 receptor 53, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r53Q9EP93 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r53Q9EP93 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms