Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aph1cQ9DCZ9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms