Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl4Q9DCU6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl4Q9DCU6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms