Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms