Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc38a3Q9DCP2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms