Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC60

Ubiad1, UbiA prenyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubiad1Q9DC60 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubiad1Q9DC60 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubiad1Q9DC60 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubiad1Q9DC60 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubiad1Q9DC60 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubiad1Q9DC60 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubiad1Q9DC60 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubiad1Q9DC60 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubiad1Q9DC60 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubiad1Q9DC60 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubiad1Q9DC60 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubiad1Q9DC60 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubiad1Q9DC60 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubiad1Q9DC60 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubiad1Q9DC60 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubiad1Q9DC60 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubiad1Q9DC60 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubiad1Q9DC60 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubiad1Q9DC60 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubiad1Q9DC60 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubiad1Q9DC60 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubiad1Q9DC60 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubiad1Q9DC60 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubiad1Q9DC60 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubiad1Q9DC60 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubiad1Q9DC60 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubiad1Q9DC60 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubiad1Q9DC60 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubiad1Q9DC60 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubiad1Q9DC60 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubiad1Q9DC60 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubiad1Q9DC60 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubiad1Q9DC60 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubiad1Q9DC60 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubiad1Q9DC60 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubiad1Q9DC60 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubiad1Q9DC60 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubiad1Q9DC60 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubiad1Q9DC60 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms