Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Swt1Q9DBQ9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Swt1Q9DBQ9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms