Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Smg9Q9DB90 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Smg9Q9DB90 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Smg9Q9DB90 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Smg9Q9DB90 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Smg9Q9DB90 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms