Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fundc1Q9DB70 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fundc1Q9DB70 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms