Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ap1s2Q9DB50 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms