Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB20

Atp5o, ATP synthase subunit O, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5oQ9DB20 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp5oQ9DB20 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.7 ms