Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd8Q9DA37 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms