Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sgf29Q9DA08 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sgf29Q9DA08 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms