Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9T8

Efhc1, EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc1Q9D9T8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efhc1Q9D9T8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms