Protein–RNA interactions for Protein: Q9D920

Borcs5, BLOC-1-related complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs5Q9D920 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs5Q9D920 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Borcs5Q9D920 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms