Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Derl3Q9D8K3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Derl3Q9D8K3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Derl3Q9D8K3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms